理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センター　RIKEN Center for Life Science Technologies

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研究・技術

超分子構造解析研究チーム

独創的な研究で分子のはたらきに迫る

 

※2018年4月の組織改編により、当研究室は生命機能科学研究センターの所属になりました。最新の情報は下記よりご覧ください。
> 生命機能科学研究センター 転写制御構造生物学研究チームのページ

チームリーダー
関根 俊一   Ph.D.

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
Tel: 045-503-9204

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研究内容

細胞の中では、タンパク質等の高分子が複数集まった巨大分子複合体がはたらいています。当チームは、巨大分子複合体の調製法を確立し、SPring- 8/SACLAの放射光や分光学的手法を駆使した新たな解析技術基盤を構築します。これを用いてRNAポリメラーゼと転写因子との複合体に代表される巨大複合体を解析し、細胞内の遺伝子・RNA・タンパク質のネットワークの動作原理を立体構造のレベルで解明します。また、細菌やウイルスが持つ複製・転写系 タンパク質は阻害剤のターゲットとして重要であることから、それらの立体構造解析により、創薬研究への貢献が期待できます。

（左）RNAポリメラーゼII 転写伸長複合体のクライオ電子顕微鏡密度マップ　（右）クライオ電子顕微鏡解析およびX線結晶構造解析によって明らかにしたRNAポリメラーゼII 転写伸長複合体の構造

研究成果

論文

1

The ratcheted and ratchetable structural states of RNA polymerase underlie multiple transcriptional functions

Sekine S, Murayama Y, Svetlov V, Nudler E, Yokoyama S.
Mol Cell, 57(3), 408-421 (2015).
2

Time-resolved Raman and polyacrylamide gel electrophoresis observations of nucleotide incorporation and misincorporation in RNA within a bacterial RNA polymerase crystal.

Antonopoulos IH, Murayama Y, Warner BA, Sekine S, Yokoyama S, Carey PR.
Biochemistry, 54(3), 652-665 (2015).
3

Development of a hexahistidine-3× FLAG-tandem affinity purification method for endogenous protein complexes in Pichia pastoris.

Higo T, Suka N, Ehara H, Wakamori M, Sato S, Maeda H, Sekine S, Umehara T, Yokoyama S.
J Struct Funct Genomics, 15(4), 191–199 (2014).
4

The selective tRNA aminoacylation mechanism based on a single G•U pair

Naganuma M, Sekine S, Chong YE, Guo M, Yang XL, Gamper H, Hou YM, Schimmel P, Yokoyama S
Nature, 510(7506), 507-511 (2014).
5

Structural basis for promoter specificity switching of RNA polymerase by a phage factor

Tagami S, Sekine S, Minakhin L, Esyunina D, Akasaka R, Shirouzu M, Kulbachinskiy A, Severinov K, Yokoyama S.
Genes Dev, 28(5), 521-531 (2014).
6

Decameric SelA•tRNASec Ring Structure Reveals Mechanism of Bacterial Selenocysteine Formation

Itoh Y, Brocker MJ, Sekine S, Hammond G, Suetsugu S, Soll D, Yokoyama S.
Science, 340(6128), 75-78 (2013).
7

Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analyses of Thermus thermophilus backtracked RNA polymerase.

Murayama Y, Sekine S, Yokoyama S.
Acta Crystallogr Sect F-Struct Biol Cryst Commun, 69(Pt2), 174-177 (2013).
8

Structural basis of transcription by bacterial and eukaryotic RNA polymerases.

Sekine S, Tagami S, Yokoyama S.
Curr Opin Struct Biol, 22(1), 110-118 (2012).
9

Crystal structure of the C17/25 subcomplex from Schizosaccharomyces pombe RNA polymerase III.

Ehara H, Sekine S, Yokoyama S.
Protein Sci, 20(9), 1558-1565 (2011).
10

Crystal structure of bacterial RNA polymerase bound with a transcription inhibitor protein.

Tagami S, Sekine S, Kumarevel T, Hino N, Murayama Y, Kamegamori S, Yamamoto M, Sakamoto K, Yokoyama S.
Nature, 468(7326), 978-982 (2010).

メンバー  *：兼務

  • 関根 俊一

    チームリーダー

    >>>Curriculum vitae
  • 清水 英明

    研究員

  • 上島 珠美

    研究員

  • 村山 祐子

    研究員

  • 江原 晴彦

    研究員

関連ページ

CLSTは、2018年4月1日からの理化学研究所第4期中期計画により、3つのセンターに改組されました。超分子構造解析研究チームの最新の情報は、下記よりご覧いただけます。


▶ 生命機能科学研究センター 転写制御構造生物学研究チーム [http://www.bdr.riken.jp/jp/research/labs/sekine-s/index.html]


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